小肠镜检查操作较为复杂，所以相比大肠镜检查其价格较高。大肠镜的检查费用约为300元，小肠镜的检查费用约为5000元。
小肠镜是一种费时费力的手术方法。小肠镜是观察小肠损伤的关键。目前可以用胶囊小肠镜来观察小肠的病变，这样做会让病人有更好的舒适感，但胶囊小肠镜与肠镜检查存在区别，建议患者遵从专业医生的诊疗方案。

肠镜可以分为小肠镜、胶囊肠镜、结肠镜以及直肠镜。小肠镜还可以观察食管、胃以及十二指肠的情况，可以明确是否存在食管炎、食管息肉、食管癌、萎缩性胃炎、胃十二指肠溃疡、胃癌等。而结肠镜、直肠镜以及小肠镜还可以行内镜下治疗以及组织活检。

肠镜可以分为小肠镜、胶囊肠镜、结肠镜以及直肠镜。小肠镜还可以观察食管、胃以及十二指肠的情况，可以明确是否存在食管炎、食管息肉、食管癌、萎缩性胃炎、胃十二指肠溃疡、胃癌等。而结肠镜、直肠镜以及小肠镜还可以行内镜下治疗以及组织活检。

肠镜可以分为小肠镜、胶囊肠镜、结肠镜以及直肠镜。小肠镜还可以观察食管、胃以及十二指肠的情况，可以明确是否存在食管炎、食管息肉、食管癌、萎缩性胃炎、胃十二指肠溃疡、胃癌等。而结肠镜、直肠镜以及小肠镜还可以行内镜下治疗以及组织活检。

肠镜检查又叫结肠镜检查，一般检查全结肠也就是大肠，一般肠镜检查从肛门经直肠乙状结肠，降结肠，横结肠，升结肠，到回盲瓣。如果要想检查小肠可以胶囊内镜，胶囊内镜可以检查全部消化道。

观察部位不同：小肠镜主要观察小肠病变。大肠镜可以观察直肠、乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠，镜头可以插至末端回肠约20-30公分；小肠镜操作费时：大肠长度约1.2-1.5m，小肠长度约5-6m，所以小肠镜检查费时费力，医生操作难度较高，通常需要两只镜子分别从上下插入对接，以达到全方位观察小肠的目的。

小肠镜和肠镜的区别就是检查的部位不一样，如果要进行肠镜检查，需要头一天之前服用导泻剂，把肠道清理干净，第2天空腹去医院进行检查，可以检查肠道内壁的结构，对发现的病灶从不同角度观察，甚至去病理组织或者染色等。所以先通过胶囊胃镜大致定位病灶，如果同时能明确诊断那是很好的，如果没看清楚，那么小肠镜进一步明确是必要的。

通常情况下，胃肠镜是一种常见的胃肠镜检查方法。是一种与食道、胃镜、结肠镜等检查相媲美的非外科检查金质，可以通过内窥镜直接看到小肠的炎症、溃疡、息肉、肿瘤等病变。另外，还可以进行组织切片、粘膜的染色、病灶的定位，以及对肠镜下出血、息肉、粘膜、狭窄等方面的检查。目前，使用最多的是两种手术方式：一种是双气囊式肠管，一种是一种新型的内窥镜。应结合病情及临床实际选择合适的检测方法。

通常来说，小肠镜检查需要1.5-2小时。
小肠镜检查是最常用于病因不明的慢性消化道出血及各种小肠病的检查和诊断方法，适用于无明显诱因出现腹胀、下腹部明显、腹泻、腹痛等情况，或者CT提示小肠壁增厚，在检查的当天要禁食，检查的前1日晚饭要照常进食，而检查前12小时要用至少3L的水冲服清肠药物来清洁肠道，检查时一般需要1.5-2小时。