肛瘘发病初期流脓较多，色黄而稠，粪臭味重。久之，脓液逐渐减少，时有时无，稀淡如水，如果过于疲劳，则脓液增多，可有粪便流出。有时瘘管外口可暂时封闭，但不久病人又会出现发烧、局部肿痛，封闭的外口可再度穿破，待脓液流出后症状才逐渐消失。

肛瘘的严重症状是会导致肛门潮湿，引起瘙痒，挤压外口有脓性分泌物，可扪及一条索状瘘管通向肛门。一般肛瘘都是由于肛周脓肿切开引流后或者自行破溃后导致的，根据肛瘘与肛门括约肌的关系，分为高位肛瘘和低位肛瘘，高位肛瘘采取肛瘘挂线手术，低位肛瘘可以采取瘘管切除手术。术后需要加强创面换药，预防假性愈合。

肛瘘常见症状：排便障碍、肛门括约肌松弛、肛门短时间阵发性钝痛、肛周皮肤潮红。肛瘘的主要症状是，肛周皮肤上的外口常有少量的脓性分泌物排出，皮肤有湿疹和瘙痒等不适。如外口封闭无脓液排出后可呈假性愈合，一旦脓肿再次形成，局部又有红肿、疼痛。如脓肿大而深，则可伴有畏寒、发热等全身性感染症状。症状反覆发作是肛瘘临床表现的特点，肛瘘外口多有隆起的肉芽创面，按之可挤出少许脓性分泌物。

可有肛门流脓、肿痛、肿块、瘙痒等症状，脓液经常刺激瘘口周围皮肤，致肛门皮肤瘙痒或湿疹。常伴有排便困难、贫血、身体消瘦、精神萎靡、神经衰弱等。一般不疼，当脓液积存于管腔内引流不畅时，局部胀痛，当脓液流出后疼痛马上减轻。

瘘管排脓较多，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成。瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升，以后封闭的瘘口破溃，又排出脓液，也可从瘘口排出气体或粪便。

肛瘘是肛门直肠周围脓肿破溃或切开多在肛门外，脓液从外口流出，原发感染多在肛窦。肛窦则是继发感染的门户，反复感染，形成瘘道，肛瘘必须及时手术治疗，找到内口，切开引流排脓。肛瘘最严重的症状是导致肛门功能下降，甚至造成大便失禁。所以肛瘘需要早期需要尽早治疗。

流脓：脓液多少与瘘管大小、长短及数目有关。新形成或炎症急性发作期的瘘管脓多、味臭、色黄而浓厚，经久不愈的瘘管脓液较少或时有时无。脓液急剧增多，局部脓肿，体温增高。常因肛瘘炎症急性发作或有支管形成。结核性肛瘘脓液多而清稀，呈米泔水样，可有干酪样坏死物。肿块：肛缘索条状硬块。

肛瘘常常会伴有肛周的干痒和有脓肿出现，也会使肠胃发生不适出现腹胀，腹痛的症状，排便也会受到影响，而且反复发作，长时间不愈合，和愈合以后很快又会肿痛破溃，肿痛和破溃这两种病症是交替出现。甚至伴有出血的症状。肛瘘这种病，是由肛周脓肿发展而来的。

肛瘘临床症状主要是表现肛旁肿痛伴间歇性流脓。可出现肛门潮湿，严重时会出现肛门瘙痒，挤压外口，有脓性分泌物溢出，可扪及一条索状管道通向肛门。肛瘘是由于肛管或直肠与肛门因病理原因导致相同的一种异常管道。